Team:IPN-UNAM-Mexico/Notebook/August 11 2009

From 2009.igem.org

(Difference between revisions)
 
Line 68: Line 68:
  <table width="100%" height=100%" "border="0" cellspacing="0" cellpadding="0">
  <table width="100%" height=100%" "border="0" cellspacing="0" cellpadding="0">
                                 <tr>
                                 <tr>
-
                                   <td><p>&nbsp;</p>
+
                                   <td><p align="right">&nbsp;</p>
 +
                                    <p align="right"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2009/a/a6/LabIconMX.png" alt="LabNotebook" width="30" height="35"> <span><a href="https://2009.igem.org/Team:IPN-UNAM-Mexico/Notebook">Back to Notebook</a></span><br>
 +
    &nbsp;</p>
                                     <p><strong>August 11th, 2009</strong></p>
                                     <p><strong>August 11th, 2009</strong></p>
                                     <p>Amplification of the promoter and RBS using  plasmidic DNA from Q04121.</p>
                                     <p>Amplification of the promoter and RBS using  plasmidic DNA from Q04121.</p>
Line 140: Line 142:
                                     <p align="left">&nbsp;</p>
                                     <p align="left">&nbsp;</p>
                                   <p align="left">&nbsp;</p>
                                   <p align="left">&nbsp;</p>
 +
                                  <p align="left">&nbsp;</p>
 +
                                  <table width="100%" height="108" border="0" align="left">
 +
                                    <tr>
 +
                                      <td height="104"><p align="center">&nbsp;</p>
 +
                                      <p>&nbsp;</p></td>
 +
                                    </tr>
 +
                                  </table>
 +
                                  <p>&nbsp;</p>
 +
                                  <p>&nbsp;</p>
 +
                                  <p>&nbsp;</p>
                                   <p align="left">&nbsp;</p>
                                   <p align="left">&nbsp;</p>
                                   <p align="left">&nbsp;</p></td>
                                   <p align="left">&nbsp;</p></td>

Latest revision as of 08:13, 14 October 2009



UNAMFCIENCIASCINVESTAV
BannerMX
HomeThe ProjectThe TeamModelingPartsCollaboration

 

LabNotebook Back to Notebook
 

August 11th, 2009

Amplification of the promoter and RBS using plasmidic DNA from Q04121.

Digestion Mix
PlasmidicDNA             4.0 μl (= 1 μg DNA)  x 20 = 80 μl
BSA                          0.5 μl                     x 20 = 10 μl
Buffer 2                    1.0 μl                      x 20 = 20 μl
Enzyme EcoRI            0.5 μl                      x 20 = 10 μl
H2O                         4.0 μl                       x 20 = 80 μl                
Cf                            10.0 μl                          200 μl

 

Load order:

Well                 Plasmid
2                      2:3 L1
3                      2:3 L2’
4                      2:3 L2”
5                      15:13
6                      15:3
7                      4:23
8                      4:23 L2

 

                        Gel 7:31 pm
Well      Plasmid            Well           Plasmid
1          Marker              1              Marker
2          2_3L2#1           2               9.1
3          2:3L2#2            3                9.3
4          2_3L2#3           4                9.4
5          3.3*                 5                9.5
6          4_23L1             6                9.6
7  No    4_23L2             7                9.7
8          7.3                   8                9.8
9          11.1                 9                9.9
10        14.2                 10              9.10
11        15.3                 11             Marker
12        15_13L2 #1      12              ----------
13        15_13L2 #2         Digest with EcoRI
14        15_13L2 #3               at 4°C
15        16.2”                  Digest with EcoRI
16        18.2*
17        19.1*                Repeat digestion –DNA
18        22.1*                Repeat digestion-DNA
19        24.2”                Repeat digestion – DNA
20        Marker

 Note: it is needed to digest lesser the plasmid 11.1.

 

Repeat digestions of the plasmids:

  • 19.1
  • 22.1
  • 24.2

which are at  -20°C in the Unicel (with 3μl of DNA) and the 9 is at 4°C.
Put 3 μl of DNA and 5 μl of water.
Digestion Mix x 10.

 

 

 

Previous Next