Team:Warsaw/Calendar-Main/12 May 2009
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<p>pho</p><pre align="left"> 2min30s 95C <br/> 3x(30s 95C, 35s 56C, 3min30s 72C) <br/> 28x(30s 95C, 35s 61C, 3min30s 72C) <br/> 10min 72C <br/> ~ 7C<br/></pre> | <p>pho</p><pre align="left"> 2min30s 95C <br/> 3x(30s 95C, 35s 56C, 3min30s 72C) <br/> 28x(30s 95C, 35s 61C, 3min30s 72C) <br/> 10min 72C <br/> ~ 7C<br/></pre> | ||
<p>mgtc</p><pre align="left"> 1min30s 95C <br/> 3x(30s 95C, 35s 48C, 1min 72C) <br/> 28x(30s 95C, 35s 58C, 1min 72C) <br/> 10min 72C <br/> ~ 7C<br/></pre> | <p>mgtc</p><pre align="left"> 1min30s 95C <br/> 3x(30s 95C, 35s 48C, 1min 72C) <br/> 28x(30s 95C, 35s 58C, 1min 72C) <br/> 10min 72C <br/> ~ 7C<br/></pre> | ||
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<li>1. GeneRuler DNA Ladder Mix #SM0333 (Fermentas)</li> | <li>1. GeneRuler DNA Ladder Mix #SM0333 (Fermentas)</li> | ||
- | <li>2. | + | <li>2. mgtc</li> |
- | <li>3. | + | <li>3. mgtc control -</li> |
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- | <li>5. | + | <li>5. GeneRuler DNA Ladder Mix #SM0333 (Fermentas)</li> |
- | <li>6. | + | <li>6. pho</li> |
- | <li>7. | + | <li>7. pho control -</li> |
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Revision as of 20:51, 25 June 2009
Lab meeting.
PCR mgtc, pho
Kama
Tasks:
- Amplification of pho, mgtc
Methods:
PCR mixture's composition:
2,5ul pfu buffer (Fermentas), 2,5ul MgSO4 (Fermentas), 1,5ul primers, 1ul dNTPs (10 mM)(new), 1ul template (Salmonella), 0,5ul pfu turbo polymerase (KNGiE), 1ul DMSO, solution was topped up with H2O to 25ul.
- PCR programs:
pho
2min30s 95C
3x(30s 95C, 35s 56C, 3min30s 72C)
28x(30s 95C, 35s 61C, 3min30s 72C)
10min 72C
~ 7C
mgtc
1min30s 95C
3x(30s 95C, 35s 48C, 1min 72C)
28x(30s 95C, 35s 58C, 1min 72C)
10min 72C
~ 7C
- Electrophoretic separation on 1% agarose gel
- Gel (from left)
- 1. GeneRuler DNA Ladder Mix #SM0333 (Fermentas)
- 2. mgtc
- 3. mgtc control -
- 5. GeneRuler DNA Ladder Mix #SM0333 (Fermentas)
- 6. pho
- 7. pho control -
Results:
Notes:
mgtc was succesfully amplified
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