"
Team:Groningen/Project
From 2009.igem.org
(Difference between revisions)
Svenjurgens (Talk | contribs) |
|||
| Line 5: | Line 5: | ||
*[[Team:Groningen/Project/Accumulation|Metal accumulation]] | *[[Team:Groningen/Project/Accumulation|Metal accumulation]] | ||
| - | [[Image:Gasvesicle.jpg|200px|thumb | + | [[Image:Gasvesicle.jpg|200px|thumb|Gas Vesicles]] |
| - | [[Image:Metaltransport.jpg|200px|thumb | + | [[Image:Metaltransport.jpg|200px|thumb|Metal transport]] |
| - | [[Image:Metal_detector.jpg|200px|thumb | + | [[Image:Metal_detector.jpg|200px|thumb|Metal sensing]] |
| - | [[Image:Metal_storage.jpg|200px|thumb | + | [[Image:Metal_storage.jpg|200px|thumb|Metal storage]] |
| + | |||
| + | Planning and requirements: | ||
| + | * Gasvesicle: | ||
| + | **Modeleren: | ||
| + | *** Drijfvermogen | ||
| + | **** Permeability | ||
| + | **** Hoeveelheid gasvesicles | ||
| + | **** Waar komen ze terecht, in hoogte. | ||
| + | *** Massa van bacterien (e.coli) | ||
| + | *** Hoe lang het duurt voordat het gaat drijven | ||
| + | **** Hoe lang het duurt totdat het tot expressie gebracht wordt | ||
| + | **** Hoe lang het duurt totdat er genoeg gasvesicles zijn | ||
| + | **** Hoe lang het blijft drijven | ||
| + | ** Lab | ||
| + | *** GvP | ||
| + | **** Cluster van biobricks | ||
| + | **** Vector besteld van artikel | ||
| + | **** Eerst tot expressie met constutatieve promotor, later pas met metal sensitive promotor | ||
| + | *** Meten | ||
| + | **** Waar zitten de bacterien, wat zijn bac concentraties op een bepaalde hoogte | ||
| + | ***** Foto’s maken op bepaalde hoogtes en dan vergelijken met standaard concentratie foto’s | ||
| + | * Metal importers | ||
| + | ** Modeleren | ||
| + | *** Import snelheid | ||
| + | *** Hoeveelheid | ||
| + | *** Max | ||
| + | ** Lab | ||
| + | *** HmtA | ||
| + | **** Zn/Cu alleen | ||
| + | **** B-type ATPase (evt. Toepassing ATP tekort?) | ||
| + | *** CitM | ||
| + | **** Divalente ionen | ||
| + | **** Zit citraat omheen | ||
| + | **** Citraat kan metalen binden die gebonden zijn. | ||
| + | *** Meten | ||
| + | **** Transporter, aan/uit mechanisme, tot welke concentratie metaal neemt het metaal op. | ||
| + | **** Concentratie metaal meten. Verschil begin en eind metaal concentratie buiten de cel meten. | ||
| + | * Promotors | ||
| + | ** Modeleren | ||
| + | *** hoe reageren ze op een metaal, concentratie metaal tov expressie achterliggend eiwit (bv GFP) | ||
| + | ** Lab | ||
| + | *** Meten | ||
| + | **** Expressie van gen achter promotor (GFP) | ||
| + | *** Cu-promotor | ||
| + | *** Arc promotor | ||
| + | * Accumulatie | ||
| + | ** Modelleren | ||
| + | *** Snelheid | ||
| + | *** Concentratie metaaliotheines | ||
| + | ** Lab | ||
| + | *** Meten | ||
| + | ***** Accumulatie meten. Door buitenconcentrati voor/na van metaal bij bac met en zonder accumulatie eiwitten te meten. | ||
| + | *** Biobrick Bba_K129004 | ||
| + | *** Rest | ||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | Order of action | ||
| + | # Drijven | ||
| + | # Metaal importeren | ||
| + | # Accumulatie | ||
| + | # Metal sensitive promotor | ||
Revision as of 20:23, 9 June 2009
[http://2009.igem.org/Team:Groningen http://2009.igem.org/wiki/images/f/f1/Igemhomelogo.png]
| The Project
|
|---|
Planning and requirements:
- Gasvesicle:
- Modeleren:
- Drijfvermogen
- Permeability
- Hoeveelheid gasvesicles
- Waar komen ze terecht, in hoogte.
- Massa van bacterien (e.coli)
- Hoe lang het duurt voordat het gaat drijven
- Hoe lang het duurt totdat het tot expressie gebracht wordt
- Hoe lang het duurt totdat er genoeg gasvesicles zijn
- Hoe lang het blijft drijven
- Drijfvermogen
- Lab
- GvP
- Cluster van biobricks
- Vector besteld van artikel
- Eerst tot expressie met constutatieve promotor, later pas met metal sensitive promotor
- Meten
- Waar zitten de bacterien, wat zijn bac concentraties op een bepaalde hoogte
- Foto’s maken op bepaalde hoogtes en dan vergelijken met standaard concentratie foto’s
- Waar zitten de bacterien, wat zijn bac concentraties op een bepaalde hoogte
- GvP
- Modeleren:
- Metal importers
- Modeleren
- Import snelheid
- Hoeveelheid
- Max
- Lab
- HmtA
- Zn/Cu alleen
- B-type ATPase (evt. Toepassing ATP tekort?)
- CitM
- Divalente ionen
- Zit citraat omheen
- Citraat kan metalen binden die gebonden zijn.
- Meten
- Transporter, aan/uit mechanisme, tot welke concentratie metaal neemt het metaal op.
- Concentratie metaal meten. Verschil begin en eind metaal concentratie buiten de cel meten.
- HmtA
- Modeleren
- Promotors
- Modeleren
- hoe reageren ze op een metaal, concentratie metaal tov expressie achterliggend eiwit (bv GFP)
- Lab
- Meten
- Expressie van gen achter promotor (GFP)
- Cu-promotor
- Arc promotor
- Meten
- Modeleren
- Accumulatie
- Modelleren
- Snelheid
- Concentratie metaaliotheines
- Lab
- Meten
- Accumulatie meten. Door buitenconcentrati voor/na van metaal bij bac met en zonder accumulatie eiwitten te meten.
- Biobrick Bba_K129004
- Rest
- Meten
- Modelleren
Order of action
- Drijven
- Metaal importeren
- Accumulatie
- Metal sensitive promotor
