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Team:Groningen/Modelling/Characterization
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| Line 238: | Line 238: | ||
// Show initial situation | // Show initial situation | ||
| - | for(var i in | + | for(var i in experiments) experiments[i].bestSolution = experiments[i].solution; |
showOutputs('cur',E,c,dc); | showOutputs('cur',E,c,dc); | ||
showOutputs('',EBest,cBest); | showOutputs('',EBest,cBest); | ||
| Line 265: | Line 265: | ||
cBest = cNew; | cBest = cNew; | ||
EBest = ENew; | EBest = ENew; | ||
| - | for(var i in | + | for(var i in experiments) experiments[i].bestSolution = experiments[i].solution; |
showOutputs('',EBest,cBest); | showOutputs('',EBest,cBest); | ||
} | } | ||
Revision as of 10:35, 5 October 2009
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- Modelling
- DetailedModel
- Characterization
- Downloads
TODO: Talk about the devices we have and in what way we want to characterize them.
Uptake measurements
| Time (min) | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 | 10 | 20 | 40 | 60 | ||
| As(III)exT(0) (µM) | 0 | x | ||||
| 10 | x | x | x | x | x | |
| 20 | x | |||||
| 50 | x | |||||
| 100 | x | |||||
To efficiently look at both time and concentration dependent processes we took samples as in the table on the right. Below we list all results, which have been used for fitting all necessary parameters.
TODO: List results. Take conversion from nmol/mg and mg/ml to µM and Vc/Vs into account.
| best | cur | gradient | solved | |
|---|---|---|---|---|
| v5/K5 | ||||
| v5 | ||||
| K5 | ||||
| k8/K7 | ||||
| k8 | ||||
| K7 | ||||
| tauBbeta4 | ||||
| tauB | ||||
| beta4 | ||||
| tauR | ||||
| beta1 | ||||
| E |
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