Team:SupBiotech-Paris/BiobricksFr

From 2009.igem.org

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|- style="background: white; color:black; text-align: left;"
 
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|B0014 + J23100
 
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|This part contains a double terminator and a constitutive prokaryotic promoter. It is a simple promoter in the goals to begin gene transcription. For Sup’biotech-Paris (2009) team this part is used when adding to a recombinant lambda phage and to begin the transcription of synthetic genes inside the Lambda phage genome.<br>
 
|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
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|B0014 + J23100 + B0030
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|B0014 + J23100  
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|This part contains a double terminator and a constitutive prokaryotic promoter and a strong RBS (BBa_B0014 + BBa_J23100 + BBa_B0030). It is a simple promoter in the goals to begin gene transcription. For Sup’biotech-Paris (2009) team this part is used when adding to a recombinant lambda phage and to begin the transcription of synthetic genes inside the Lambda phage genome.
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|Cette BioBrick contient un double terminateur et un promoteur procaryote constitutif. C’est un promoteur simple qui a pour but d’initier la transcription d’un gène. Pour l’équipe Sup’biotech-Paris (2009) cette BioBrick est utilisée ajoutée à un phage Lambda recombinant. Elle va initier la transcription des gènes synthétiques contenus dans le génome du phage Lambda.<br>
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|R0010 + B0030  
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|B0014 + J23100 + B0030  
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|This part contains the pLac promoter and a ribosome binding site (BBa_R0010 + BBa_B0030). The Lac promoter is constitutively activated, but it can be repressed by the Lac I repressor from E.coli. This promoter is really useful to control a gene expression by inactivating it with LacI repressor. When LacI is absent the gene should be expressed, and in the presence of LacI, pLac is inhibited. So this part is really suitable for gene expression control by inactivation of pLac with LacI.
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|Cette BioBrick contient un double terminateur, un promoteur procaryote constitutif et un fort site de fixation du ribosome (RBS) (BBa_B0014 + BBa_J23100 + BBa_B0030). C’est un promoteur simple qui a pour but de d’initier la transcription d’un gène. Pour l’équipe Sup’biotech-Paris (2009) cette BioBrick est utilisée ajoutée à un phage Lambda recombinant. Elle va initier la transcription des gènes synthétiques contenus dans le génome du phage Lambda. <br>
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We can use this part to control a failed feedback mechanism which induces the Lambda phage lytic cycle (Link plasmide Wiki).
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In E.coli, pLac is a part of the lactose operon. LacI is constantly expressed and represses the pLac. In the presence of Lactose, LacI is inhibited and pLac is active and allows the transcription of beta-galactosidase. Lactose can be substituted by IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside).  
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This part already contains a strong RBS to begin directly a gene transcription.  
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|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
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|P1003 + B0014
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|R0010 + B0030
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|This part contains a kanamycin resistance cassette and a double terminator (BBa_P1003 + BBa_B0014). This allows the kanamycin cassette to be functional.  
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|Cette BioBrick contient le promoteur pLac et un site de fixation du ribosome (RBS) (BBa_R0010 + BBa_B0030). Le promoteur Lac est constitutivement actif, mais il peut être réprimé par le répresseur Lac I de <i>E.coli</i>. Ce promoteur est très utile pour contrôler l’expression d’un gène en l’inactivant avec le répresseur LacI. Lorsque LacI est absent le gène est exprimé, et en présence de LacI, pLac est inhibé. Cette BioBrick est donc adéquate pour l’expression de gènes contrôlés par inactivation de pLac avec LacI. <br>
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The cassette can be used to design a recombinant vector by gene insertion in a non lytic bacteriophage as the Lambda phage.  
+
Cette BioBrick peut être utilisée pour contrôler un mécanisme de rétrocontrôle qui induit le cycle lytique du phage Lambda (Link plasmide Wiki). <br>
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In fact it allows us to know if a bacteriophage is modified or not and if the inserted gene is expressed or not. When the virus is modified the kanamycin cassette induces a kanamycin resistance, so the bacteria become resistance, and when the virus is not modified bacteria are killed by kanamycin.  
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Dans  <i>E.coli</i>, pLac fait partie de l’opéron lactose. LacI est constamment exprimé et réprime pLac. En présence de Lactose, LacI est inhibé et pLac est actif et permet la transcription de beta-galactosidase. Le Lactose peut être substitué par IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside). <br>
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This part is completed by B0014 + P1003 + B0014 to finish the transcription before the resistance cassette.
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Cette BioBrick contient déjà un fort RBS pour induire directement la transcription d’un gène. <br>
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|B0014 + P1003 + B0014  
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|P1003 + B0014  
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|This part contains a double terminator and a functional kanamycin resistance cassette (promoter, resistance against kanamycin and a double terminator). It is reliable to design a recombinant vector by gene insertion in a non lytic bacteriophage as the Lambda phage.  
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|Cette BioBrick contient une cassette de résistance à la kanamycine et un double terminateur (BBa_P1003 + BBa_B0014). Ce qui permet à la cassette kanamycine d’être fonctionnelle. <br>
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In fact it allows us to know if a bacteriophage is modified or not and if the inserted gene is expressed or not. When the virus is modified the kanamycin cassette induces a kanamycin resistance, so the bacteria become resistance, and when the virus is not modified bacteria are killed by kanamycin.  
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La cassette peut être utilisée pour créer un vecteur recombinant par insertion d’un gène dans un bactériophage non lytique comme le phage Lambda. <br>
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We can use this part as a reporter, or as a simple resistance cassette.  
+
En fait, il permet de savoir si le bactériophage est modifié ou non et si l’insert est exprimé ou non. Lorsque le virus est modifié, la cassette kanamycine induit une résistance à la kanamycine, donc la bactérie devient résistante. Lorsqu’elles ne sont pas modifiées les bactéries sont tuées par la kanamycine. <br>
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The double terminator allows the RNA translation arrest before the resistance cassette, so this is already created to insert a coding gene with its RBS before the resistance cassette.
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Cette BioBrick est complétée par B0014 + P1003 + B0014 pour finir la transcription avant la cassette de résistance. <br>
|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
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|C0012 + B0014
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|B0014 + P1003 + B0014
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|This part contains a LacI repressor and a terminator (BBa_C0012 + BBa_B0014). The LacI repressor repressed pLac promoter from the E.coli lactose operon. So LacI repressor is really reliable to use when we want to control a gene expression by using pLac promoter. In fact when LacI is not expressed, pLac is activated, and when there is an expression of LacI, pLac is inhibited. We can easily design a system to induce the transcription of LacI and creates a failed feedback mechanism for pLac inhibition.  
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|Cette BioBrick contient un double terminateur et une cassette de résistance à la kanamycine fonctionnelle (promoteur, résistance à la kanamycine et un double terminateur). Construire un vecteur recombinant par insertion de gène dans un bactériophage non lytique comme le phage Lambda est fiable. <br>
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History:
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En fait il permet de savoir si un bactériophage est modifié ou non et si l’insert est exprimé ou non. Lorsque le virus est modifié, la cassette de kanamycine induit une résistance à la kanamycine, donc la bactérie devient résistante et lorsque le virus n’est pas modifié, les bactéries sont tuées par la kanamycine. <br>
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In E.Coli, pLac is a part of the lactose operon. LacI is constantly expressed and represses the pLac. In the presence of Lactose, LacI is inhibited and pLac is active and allows the transcription of beta-galactosidase. Lactose can be substituted by IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside).  
+
Cette BioBrick peut être utilisée comme un  reporter ou comme une simple cassette de résistance. <br>
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Le double terminateur permet l’arrêt de la translation d’ARN avant la cassette de résistance, donc c’est déjà créé pour insérer un gène codant avec son RBS avant la cassette de résistance. <br>
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|B0030 + C0012 + B0014  
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|C0012 + B0014
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|This part contains a strong ribosome binding site, the LacI repressor and a double terminator (BBa_B0030 + BBa_C0012 + BBa_B0014). This brick comes from the BBa_K292005. The LacI repressor represses pLac promoter from the E.coli lactose operon. So LacI repressor and this bio-brick are really reliable to use when we want to control a gene expression by using pLac promoter. In fact when LacI is not expressed, pLac is activated, and when there is an expression of LacI, pLac is inhibited. We can easily design a system to induce the transcription of LacI by using another operon as the tetracycline operon and creates a failed feedback mechanism for pLac inhibition and so, for gene expression inhibition.
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|Cette BioBrick contient un répresseur LacI et un terminateur (BBa_C0012 + BBa_B0014). Le répresseur LacI réprime le promoteur pLac de l’opéron lactose d’<i>E.coli</i>. Donc le répresseur de LacI est très fiable pour contrôler l’expression d’un gène en utilisant un promoteur pLac. En fait quand LacI n’est pas exprimé, pLac est activé, et quand il y a expression de LacI, pLac est inhibé. Un système pour induire la transcription de LacI peut facilement être créé et cré un mécanisme de rétrocontrôle pour l’inhibition de pLac. <br>
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The LacI (BBa_K292006) already contains a strong RBS and a double terminator, so this brick is ready to use!
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Histoire: <br>
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History:  
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Dans <i>E.coli</i>, pLac fait partie de l’opéron lactose. LacI est constamment exprimé et réprime pLac. En présence de Lactose, LacI est inhibé et pLac est actif et permet la transcription de beta-galactosidase. Le lactose peut être substitué par IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside). <br>
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In E.Coli, pLac is a part of the lactose operon. LacI is constantly expressed and represses the pLac. In the presence of Lactose, LacI is inhibited and pLac is active and allows the transcription of beta-galactosidase. Lactose can be substituted by IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside).
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|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
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|BBa_I712669 + BBa_B0014
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|B0030 + C0012 + B0014
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|This part contains a green fluorescence protein (GFP) under control of a CMV promoter and its double terminator (BBa_I712669 + BBa_B0014). This part is reliable to use when we want to know if a gene is inserted into a eukaryotic cell. For example we can use it when we design a recombinant virus. In fact we inserted this bio-brick into the synthetic virus; finally we are able to see if the virus can infect the targeted cells.
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|Cette BioBrick contient un fort site de fixation de ribosome (RBS), le répresseur LacI et un double terminateur (BBa_B0030 + BBa_C0012 + BBa_B0014). Cette BioBrick vient de BBa_K292005. Le répresseur LacI réprime le promoteur pLac de l’opéron lactose d’<i>E.coli</i>. Donc le répresseur LacI et cette BioBrick sont très fiables pour le contrôle de l’expression d’un gène en utilisant le promoteur pLac. En fait quand LacI n’est pas exprimé, pLac est activé, et quand LacI est exprimé, pLac est inhibé. Un système induisant la transcription de LacI peut facilement être créé en utilisant un autre opéron comme l’opéron tétracycline et cré  un mécanisme de rétrocontrôle pour l’inhibition de pLac et donc pour l’inhibition de  l’expression d’un gène.  
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This bio-brick already contains a terminator, so it is ready to use.  
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LacI (BBa_K292006) contient déjà un fort RBS et un double terminateur, donc cette BioBrick est prête à l’emploi!
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Histoire:
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Dans <i>E.coli</i>, pLac fait partie de l’opéron lactose. LacI est constamment exprimé et réprime pLac. En présence de Lactose, LacI est inhibé et pLac est actif et permet la transcription de beta-galactosidase. Le lactose peut être substitué par IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside). <br>
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|BBa_K292008
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|BBa_I712669 + BBa_B0014
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|This part contains a SV40 nucleus targeting sequence (DTS). This part is reliable to use to increase the level of gene transfection efficiency.
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|Cette BioBrick contient une  green fluorescence protein (GFP) sous-contrôle d’un  promoteur CMV et un double terminateur (BBa_I712669 + BBa_B0014). Cette BioBrick peut être utilisée pour savoir si un gène est inséré dans une cellule eucaryote. Elle peut être utilisée par exemple pour créer un  virus recombinant. En fait nous avons inséré cette BioBrick dans un  virus synthétique, elle nous a permis de voir si le virus pouvait infecter les cellules cibles.
-
Any plasmid will rarely reach the nucleus if we do not provide to it, the necessary element to trigger a mechanism of nuclear incorporation. Studies were conducted on the use of specific sequences for nuclear import of genetic sequences: DTS sequences (DNA Nuclear Targeting Sequence). This bio-brick is able to play this role.
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Cette BioBrick contient déjà un terminateur, donc elle prête à l’emploi.<br>
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Sequence:
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5’ GCATGCTTTG CATACTTCTG CCTGCTGGGG AGCCTGGGGA CTTTCCACAC CCTAACTGAC ACACATTCCA CAGCTGGTTC TTTCCGCCTC AGAAGGTACC T 3’
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|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
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This sequence, known for having the ability to bind to 10 different transcription factors, provides the transportation of DNA to the nucleus. Added to the therapeutic plasmid, this sequence ensures the entry and the expression of therapeutic plasmid into the nucleus of the target cell.
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|BBa_K292008
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|Cette BioBrick contient une séquence d’adressage nucléaire SV40 (DTS). Elle peut être utilisée pour augmenter l’efficacité du taux de transfection du gène.
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Les plasmides atteignent rarement le noyau s’ils n’ont pas de mécanisme d’incorporation nucléaire. Des études ont été menées sur l’utilisation de séquences pour l’importation nucléaire de  séquences génétiques : les séquences DTS (DNA Nuclear Targeting Sequence). Cette BioBrick est capable de jouer ce rôle.
 +
Cette séquence, connue pour avoir la capacité de fixer 10 facteurs de transcription différents, assure le transport de l’ADN jusqu’au noyau. Ajoutée au plasmide thérapeutique, cette séquence permet l’entrée et l’expression du plasmide thérapeutique dans le noyau de la cellule cible.
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|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
 
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|Bba_K292009
 
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|This part contains a gene coding for the Stem cell factor (SCF) or c-kit-ligand. Stem cell factor (SCF) is a growth factor that stimulates the survival, proliferation, and differentiation of hematopoietic cells. It is also a specific marker for Stem cells. When binding to c-kit, the c-kit ligand induces the c-kit dimerization and the particle encapsidation. So this is a reliable ligand to transfect a gene into stem cells.
 
|-
|-
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|Bba_K292009
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|Cette BioBrick contient un gène codant pour un Stem cell factor (SCF) ou c-kit-ligand. Stem cell factor (SCF) est un facteur de croissance stimulant la survie, la prolifération et la  différentiation de cellules hématopoïétiques. C’est aussi un marqueur spécifique des cellules souches. Quand il se fixe à c-kit, le  c-kit ligand induit une dimérisation du c-kit et la particule d’encapsidation. Donc c’est un ligand efficace pour transfecter un gène dans les cellules souches.
 +
 +
|- style="background: #C0C0C0;; color:black; text-align: left;"
|BBa_K292010
|BBa_K292010
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|This part contains the D protein from the Lambda phage. The lambda phage wild type has on its capsid, the D protein, which is in charge of the stabilization of the entire capsid. The D protein is exposed on the entire outer surface of the capsid, so this protein is an ideal candidate to be fused to a cellular internalization protein.
+
|Cette BioBrick contient la protéine D provenant du phage Lambda. Le phage lambda sauvage possède la protéine D sur sa capside, qui est responsable de la stabilité de toute la capside. La protéine D est exposée sur toute la surface de la capside, elle est la candidate idéale pour être fusionnée à une protéine d’internalisation cellulaire.<br>
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The D protein is organized as a trimer. Each monomer is distant of 5,1nm in a trimer. The crystal structure of the protein D, as a trimeric form, shows that the Nter and Cter ends, are exposed at the capsid surface, and are very closed from each other. The Nter and Cter ends are exposed at the mature capsid surface, which allows the choice for the location of the fusion protein (Nter or Cter). However, several studies have showed that the fusion to the Cter end, allows better results.
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La protéine D est organisée en trimère. Chaque monomère est distant de 5,1nm. La structure cristallographique de la protéine D, comme toute  forme trimérique, montre que les extrémités Nter et Cter, sont exposées à la surface de la capside, et sont très proches les unes des autres. Les extrémités Nter et Cter, sont exposées à la surface de la capside mature ce qui donne le choix pour la localisation de la  protéine de fusion (Nter ou Cter). Cependant, plusieurs études ont montrées  la protéine de fusion en Cter donne de meilleurs résultats.<br>
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So the D protein can be used to perform a fusion protein. The internalization protein, called polypeptide III, is issued of the adenovirus penton base. It can be used to design a recombinant Lambda phage able to infect eukaryotic cells.
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Donc la protéine D peut être utilisée pour créer une protéine de fusion. La protéine d’internalisation, appelée polypeptide III, est issue d’une base de penton d’adénovirus. Elle peut être utilisée pour créer un phage Lambda recombinant capable d’infecter des cellules eucaryotes. Cette séquence vient du génome ADN du phage Lambda. Il a été amplifié par PCR et  introduite dans un plasmide qui vient de la registry. Nous avons quelques problèmes pour trouver les meilleures températures d’hybridation des amorces. Et nous avons procédé à de nombreux essais pour l’introduire dans un plasmide.  
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This sequence comes from the Lambda phage genomic DNA. It has been amplified by PCR and introduced into a plasmid which comes from the registry.
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We have some problem to find the best primers annealing temperature. And we performed a lot of trial to introduce it into a plasmid.
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|- style="background: grey; color:white; text-align: center; font-weight:bold; border:1px;"
|- style="background: grey; color:white; text-align: center; font-weight:bold; border:1px;"
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Latest revision as of 02:12, 22 October 2009

framless


BioBricks Description
B0014 + J23100 Cette BioBrick contient un double terminateur et un promoteur procaryote constitutif. C’est un promoteur simple qui a pour but d’initier la transcription d’un gène. Pour l’équipe Sup’biotech-Paris (2009) cette BioBrick est utilisée ajoutée à un phage Lambda recombinant. Elle va initier la transcription des gènes synthétiques contenus dans le génome du phage Lambda.
B0014 + J23100 + B0030 Cette BioBrick contient un double terminateur, un promoteur procaryote constitutif et un fort site de fixation du ribosome (RBS) (BBa_B0014 + BBa_J23100 + BBa_B0030). C’est un promoteur simple qui a pour but de d’initier la transcription d’un gène. Pour l’équipe Sup’biotech-Paris (2009) cette BioBrick est utilisée ajoutée à un phage Lambda recombinant. Elle va initier la transcription des gènes synthétiques contenus dans le génome du phage Lambda.
R0010 + B0030 Cette BioBrick contient le promoteur pLac et un site de fixation du ribosome (RBS) (BBa_R0010 + BBa_B0030). Le promoteur Lac est constitutivement actif, mais il peut être réprimé par le répresseur Lac I de E.coli. Ce promoteur est très utile pour contrôler l’expression d’un gène en l’inactivant avec le répresseur LacI. Lorsque LacI est absent le gène est exprimé, et en présence de LacI, pLac est inhibé. Cette BioBrick est donc adéquate pour l’expression de gènes contrôlés par inactivation de pLac avec LacI.

Cette BioBrick peut être utilisée pour contrôler un mécanisme de rétrocontrôle qui induit le cycle lytique du phage Lambda (Link plasmide Wiki).
Dans E.coli, pLac fait partie de l’opéron lactose. LacI est constamment exprimé et réprime pLac. En présence de Lactose, LacI est inhibé et pLac est actif et permet la transcription de beta-galactosidase. Le Lactose peut être substitué par IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside).
Cette BioBrick contient déjà un fort RBS pour induire directement la transcription d’un gène.

P1003 + B0014 Cette BioBrick contient une cassette de résistance à la kanamycine et un double terminateur (BBa_P1003 + BBa_B0014). Ce qui permet à la cassette kanamycine d’être fonctionnelle.

La cassette peut être utilisée pour créer un vecteur recombinant par insertion d’un gène dans un bactériophage non lytique comme le phage Lambda.
En fait, il permet de savoir si le bactériophage est modifié ou non et si l’insert est exprimé ou non. Lorsque le virus est modifié, la cassette kanamycine induit une résistance à la kanamycine, donc la bactérie devient résistante. Lorsqu’elles ne sont pas modifiées les bactéries sont tuées par la kanamycine.
Cette BioBrick est complétée par B0014 + P1003 + B0014 pour finir la transcription avant la cassette de résistance.

B0014 + P1003 + B0014 Cette BioBrick contient un double terminateur et une cassette de résistance à la kanamycine fonctionnelle (promoteur, résistance à la kanamycine et un double terminateur). Construire un vecteur recombinant par insertion de gène dans un bactériophage non lytique comme le phage Lambda est fiable.

En fait il permet de savoir si un bactériophage est modifié ou non et si l’insert est exprimé ou non. Lorsque le virus est modifié, la cassette de kanamycine induit une résistance à la kanamycine, donc la bactérie devient résistante et lorsque le virus n’est pas modifié, les bactéries sont tuées par la kanamycine.
Cette BioBrick peut être utilisée comme un reporter ou comme une simple cassette de résistance.
Le double terminateur permet l’arrêt de la translation d’ARN avant la cassette de résistance, donc c’est déjà créé pour insérer un gène codant avec son RBS avant la cassette de résistance.

C0012 + B0014 Cette BioBrick contient un répresseur LacI et un terminateur (BBa_C0012 + BBa_B0014). Le répresseur LacI réprime le promoteur pLac de l’opéron lactose d’E.coli. Donc le répresseur de LacI est très fiable pour contrôler l’expression d’un gène en utilisant un promoteur pLac. En fait quand LacI n’est pas exprimé, pLac est activé, et quand il y a expression de LacI, pLac est inhibé. Un système pour induire la transcription de LacI peut facilement être créé et cré un mécanisme de rétrocontrôle pour l’inhibition de pLac.

Histoire:
Dans E.coli, pLac fait partie de l’opéron lactose. LacI est constamment exprimé et réprime pLac. En présence de Lactose, LacI est inhibé et pLac est actif et permet la transcription de beta-galactosidase. Le lactose peut être substitué par IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside).


B0030 + C0012 + B0014 Cette BioBrick contient un fort site de fixation de ribosome (RBS), le répresseur LacI et un double terminateur (BBa_B0030 + BBa_C0012 + BBa_B0014). Cette BioBrick vient de BBa_K292005. Le répresseur LacI réprime le promoteur pLac de l’opéron lactose d’E.coli. Donc le répresseur LacI et cette BioBrick sont très fiables pour le contrôle de l’expression d’un gène en utilisant le promoteur pLac. En fait quand LacI n’est pas exprimé, pLac est activé, et quand LacI est exprimé, pLac est inhibé. Un système induisant la transcription de LacI peut facilement être créé en utilisant un autre opéron comme l’opéron tétracycline et cré un mécanisme de rétrocontrôle pour l’inhibition de pLac et donc pour l’inhibition de l’expression d’un gène.

LacI (BBa_K292006) contient déjà un fort RBS et un double terminateur, donc cette BioBrick est prête à l’emploi! Histoire: Dans E.coli, pLac fait partie de l’opéron lactose. LacI est constamment exprimé et réprime pLac. En présence de Lactose, LacI est inhibé et pLac est actif et permet la transcription de beta-galactosidase. Le lactose peut être substitué par IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside).

BBa_I712669 + BBa_B0014 Cette BioBrick contient une green fluorescence protein (GFP) sous-contrôle d’un promoteur CMV et un double terminateur (BBa_I712669 + BBa_B0014). Cette BioBrick peut être utilisée pour savoir si un gène est inséré dans une cellule eucaryote. Elle peut être utilisée par exemple pour créer un virus recombinant. En fait nous avons inséré cette BioBrick dans un virus synthétique, elle nous a permis de voir si le virus pouvait infecter les cellules cibles.

Cette BioBrick contient déjà un terminateur, donc elle prête à l’emploi.

BBa_K292008 Cette BioBrick contient une séquence d’adressage nucléaire SV40 (DTS). Elle peut être utilisée pour augmenter l’efficacité du taux de transfection du gène.

Les plasmides atteignent rarement le noyau s’ils n’ont pas de mécanisme d’incorporation nucléaire. Des études ont été menées sur l’utilisation de séquences pour l’importation nucléaire de séquences génétiques : les séquences DTS (DNA Nuclear Targeting Sequence). Cette BioBrick est capable de jouer ce rôle. Cette séquence, connue pour avoir la capacité de fixer 10 facteurs de transcription différents, assure le transport de l’ADN jusqu’au noyau. Ajoutée au plasmide thérapeutique, cette séquence permet l’entrée et l’expression du plasmide thérapeutique dans le noyau de la cellule cible.


Bba_K292009 Cette BioBrick contient un gène codant pour un Stem cell factor (SCF) ou c-kit-ligand. Stem cell factor (SCF) est un facteur de croissance stimulant la survie, la prolifération et la différentiation de cellules hématopoïétiques. C’est aussi un marqueur spécifique des cellules souches. Quand il se fixe à c-kit, le c-kit ligand induit une dimérisation du c-kit et la particule d’encapsidation. Donc c’est un ligand efficace pour transfecter un gène dans les cellules souches.
BBa_K292010 Cette BioBrick contient la protéine D provenant du phage Lambda. Le phage lambda sauvage possède la protéine D sur sa capside, qui est responsable de la stabilité de toute la capside. La protéine D est exposée sur toute la surface de la capside, elle est la candidate idéale pour être fusionnée à une protéine d’internalisation cellulaire.

La protéine D est organisée en trimère. Chaque monomère est distant de 5,1nm. La structure cristallographique de la protéine D, comme toute forme trimérique, montre que les extrémités Nter et Cter, sont exposées à la surface de la capside, et sont très proches les unes des autres. Les extrémités Nter et Cter, sont exposées à la surface de la capside mature ce qui donne le choix pour la localisation de la protéine de fusion (Nter ou Cter). Cependant, plusieurs études ont montrées la protéine de fusion en Cter donne de meilleurs résultats.
Donc la protéine D peut être utilisée pour créer une protéine de fusion. La protéine d’internalisation, appelée polypeptide III, est issue d’une base de penton d’adénovirus. Elle peut être utilisée pour créer un phage Lambda recombinant capable d’infecter des cellules eucaryotes. Cette séquence vient du génome ADN du phage Lambda. Il a été amplifié par PCR et introduite dans un plasmide qui vient de la registry. Nous avons quelques problèmes pour trouver les meilleures températures d’hybridation des amorces. Et nous avons procédé à de nombreux essais pour l’introduire dans un plasmide.


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