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Team:Paris/13 June 2009
From 2009.igem.org
NoteBook
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Summary
Find a copy and the rest of the brainstorming session in the Brainstorm section
Partie biologie :
- La bactérie gram négative :
- 2 méca appliqué lors de la création de vésicules.
- Chez E Coli: mécanisme le plus utilisé de type 6 .
- La création de la vésicule
La vésicule :
- bicouche ( membrane interne et externe),
- récemment: publication sur les protéines sur la couche externes et qui vt se retrouver concentrer sur la membrane interne de la vésicule ( idée d 'ancrage)
L' environnement cytoplasmique et périsplamique est très différent, par ex : le potentiel redox est plus fort dans le cytoplasme, entrainant que les ponts dissulfure ne se forme pas dans le cyto alors qu ils peuvent se faire ds le périplasme.
Les Omvs:
- Ils existent plusieurs tailles de vésicules ( 50 - 250) nm.
- Une bactérie intéressante proche de E Coli est Marcescens.
- Trace de bibliographie sur la composition des OMVs.
- Idée: introduire de l 'ADN dans la vésicule, approfondir l'idée à partir d' un article.
Les facteurs de virulences:
- Les facteurs enrichissant :On ne connait pas les protéines.
Comment produire les OMV?
- Différentes techniques ont été développées:Plusieurs mutants avec plusieurs contraintes extérieurs permettent de faire produire une grande concentration de vésicule chez E coli.
Par exemple :
- la température + mutation
- milieu de stress
- Les vésicules se développe la ou il y a le moins d' ancrage au niveau de la membrane ( spatialisation de la création des vésicules)
Application:
- protéine a insérer ou toxine dans la vésicule .
- Faire produire un biocarburant a la bactérie et l évacuer par la vésicule.
- Biodépolution :Couper une pop de bactérie en 2; une bactérie va dégrader le substituant, puis par l intermédiaire de vésicule , on a la transmission du substituant a dégrader par une autre population de bactérie plus optimal au niveau de la dégradation.
Des grandes question en ressortes:
- Que va t on mettre?
- Peut on adapter un récepteur a une autre population?
- Mettre de l information dans une vésicule afin de l envoyer a une bactérie.
Faire des recherches sur le nombre de vésicules, voir de la bibliographie.
Connaitre le temps de production , la fréquence.
Une direction :
- Mélange de membrane au niveau des composition. Les facteurs de virulence contenu ds les vésicules sont capable d'infecter d autres type de bactérie, des cellules humaines.
-> création d'un système d'information unidirectionnel.
Note :
- Possibilité de travailler avec une cellule eucaryote à Cochin , mais l idée à écarter car on a pas forcément le matériel.
- Possibilité de microfluidique : type de filtrage ds les comportements des cellules en fonction des différentes communautés.
Idée :
- Système de bactérie qui produit des facteurs de protection à d 'autres bactéries qui ne peuvent pas.
- Système de renforcement ds de mauvaise condition pour la production de vésicules
